Huolellinen hammastarkastus alkaa pään alueen tutkimisella hereillä. Tähän kuuluu kuonon, imusolmukkeiden ja purennan arviointi. Purenta on tärkeää arvioida hereillä tai viimeistään ennen intubointia.
Nukutuksessa tarkistetaan aluksi nielu, tonsillat, kitalaki, kieli ja suun kaikki limakalvopinnat. Ei ole tavatonta, että suusta löytyy hammashoidossa kasvainmuutoksia. Hammaskiven määrä arvioidaan hammaskarttaan ennen hammaskiven poistoa.
Plakki ja hammaskivi poistetaan ennen tarkempaa hammastarkastusta. Hammaskiven poisto tehdään nukutuksessa, sillä toimenpide aiheuttaa epämukavuutta tai jopa kipua jos suussa on runsaasti tulehdusta tai alkavia sairauksia, kuten parodontiittia. Hereillä olevalta potilaalta hammaskiveä ei saa puhdistettua kaikkien hampaiden kaikilta pinnoilta ja ientaskuista. Hammaskiven poistoon käytetään ultraäänilaitetta ja käsi-instrumentteja. Hammaskiven puhdistuksen jälkeen hampaat kiillotetaan kiillotuspastalla, joka tasoittaa kiilteen. Tasoitetulle kiillepinnalle plakki ei muodostu yhtä nopeasti kuin karhealle. Kiillotus myös poistaa kiilteen pinnalle jäänyttä plakkia.
Hammastarkastukseen tarvitaan koetin-ientaskumittari, peili ja hammaskartta. Jokaisen hampaan kaikki pinnat käydään läpi. Ientaskumittarilla mitataan ientaskujen syvyys joka kohdasta hampaiden ympäriltä. Koiralla normaali ientasku on 0–3 mm, kissalla 0–1 mm. Ientaskumittarilla mitataan myös ikenien vetäytyminen. Koettimella heilutetaan hammasta ja merkitään liikkuvuus. Terve ien ei vuoda verta. Verenvuoto merkitään asteikolla 0–3. Furkaatio tarkoittaa ientaskumittarin uppoamista monijuuristen hampaiden juurten väliin. Furkaatio merkitään asteikolla 1-3, jossa 3 tarkoittaa tilannetta, jossa ientaskumittarin saa kokonaan juurten välistä.
Lisäksi merkitään kaikki muut muutokset suuontelossa ja limakalvoilla. Tällaisia muutoksia ovat puuttuvat ja ylimääräiset hampaat, värjäytyneet hampaat, hampaiden ja kiilteen kulumat ja murtumat sekä massat, haavaumat ja limakalvovauriot.
Hammastarkastuksen jälkeen hampaat röntgenkuvataan.